Em Shinobi, o jogador controla um ninja nos dias modernos chamado Joe Musashi que tem que parar uma organização terrorista chamada Zeed que está sequestrando seus alunos de seu clã.
As mecânicas dessa versão são baseadas na versão do Master System. No entanto, Tengen removeu todas as armas de curto alcance (a espada, o nunchaku e a corrente) e as granadas. Apenas os socos básicos, chutes, punhais e pistola foram mantidos. Ao contrário da versão do Master System, o jogador só pode disparar uma shuriken, uma adaga ou uma bala na tela ao mesmo tempo, mesmo depois de obter power-ups. No entanto, o estoque máximo de habilidades do ninjutsu foi aumentado para cinco. Todos as fases de rolagem vertical (como a Missão 2-2 e Missão 3-2) foram reprojetadas em fases de rolagem horizontal.
Todos os textos foram traduzidos e acentuados. Todas os textos em formas de gráficos também foram editados.
Esta tradução usa como base o hack feito romhacker The Jabu, que melhorou todos os gráficos do jogo, deixando-o mais próximo da versão oficialmente lançada para Master System ou do que seria um possível port oficial do jogo para o sistema NES.
