The Krion Conquest

O ano é 1999. O jogador é colocado no meio de uma guerra que já encontra-se perdida. Quando o Império de Akuduma, (conhecido como Império Krion fora do Japão), ataca a Terra com seu exército de robôs. Nenhuma arma já conhecida é útil contra esse oponente. No entanto, todos os robôs são fracos contra magia.

O jogador controla um personagem que solta diferentes tipos de projéteis baseado no cajado que o jogador tem selecionado. Ao contrário dos primeiros Mega Man, o jogo permite que o jogador se abaixe e atire para cima.